Фамилия Мутли — редкий случай в русском ономастиконе. Она не вписывается в привычные модели русских фамилий на -ов, -ев или -ин, и её происхождение почти наверняка нерусское.

Самая вероятная версия — немецкое или скандинавское происхождение. В немецком языке существует фамилия Mutli, которая может быть вариантом написания фамилии Muttli или Muthli. Основа этих фамилий восходит к средневерхненемецкому muot — «дух», «мужество», «настроение». Суффикс -li в немецких и швейцарских фамилиях — уменьшительный (аналог русского -к-), так что Mutli можно перевести как «смельчак» или «храбрец». В Швейцарии и южной Германии такие фамилии на -li встречаются часто.

Вторая версия — финно-угорские корни. В финском языке mutli означает «грязь» или «слякоть», а mutla — «кусок», «комок». Фамилия могла возникнуть как прозвище по месту жительства (на болотистой почве) или по внешности человека. Учитывая, что в России фамилия Мутли встречается в Карелии и соседних регионах, эта версия тоже имеет право на существование, хотя менее распространена.

Третий вариант — искажение при переписи более сложной фамилии. В XIX веке переселенцы (немцы-колонисты, финны или прибалты) могли получить упрощённую запись своей фамилии в русских документах. Например, немецкая Mutschler или шведская Möller при записи «на слух» легко превращались в Мутли.

Географически фамилия Мутли встречается крайне редко. По открытым данным, основные носители живут в России (Петербург, Карелия, Мурманская область) и в странах Балтии. В дореволюционных метрических книгах фамилия фиксировалась в приходах лютеранской церкви, что подтверждает её немецко-скандинавское происхождение.

Словообразовательно фамилия не имеет русского суффикса — это чистая основа. В русском языке она склоняется как существительное мужского рода: Мутли, Мутли, Мутли. Женский вариант не склоняется.

Таким образом, Мутли — скорее всего, немецкая фамилия, пришедшая в Россию с колонистами или через Прибалтику. Значение её связано с личным качеством («смелый»), а не с профессией или отчеством.