Фамилия Мужиченко образована по распространённой на украинских землях модели с патронимическим суффиксом -енко, который изначально означал «сын» или «потомок». То есть Мужиченко — это буквально «сын Мужика», а в более широком смысле — потомок человека, носившего прозвище Мужик. Такая словообразовательная схема в XV–XVII веках была типична для казацкой старшины, мещан и крестьян на территории современной Центральной и Левобережной Украины, откуда фамилия впоследствии распространилась дальше.

Само прозвище Мужик, лёгшее в основу фамилии, многозначно, и здесь стоит разобраться, какая из версий выглядит убедительнее. Самая прямая и очевидная — связь со словом «муж» в значении «взрослый, самостоятельный человек, глава семьи». В древнерусском языке «муж» означало не только супруга, но и свободного общинника, воина, члена вече. Прозвище Мужик в этом ключе могло подчёркивать зрелость, независимость или хозяйственную основательность человека.

Существует и менее известная, но любопытная версия, отмеченная в диалектной лексике: в Тверской и Псковской губерниях словом «мужак» называли силача, крепкого и рослого мужчину. Если прозвище возникло в этих краях, оно могло указывать на физическую мощь предка. Однако для фамилии с суффиксом -енко, который тяготеет к украинской традиции, такая севернорусская привязка менее вероятна, хотя полностью исключать её нельзя — носители прозвища могли мигрировать.

Наконец, третья трактовка отсылает к социальному смыслу: мужиком на Руси и в Речи Посполитой называли земледельца, пахаря, простого поселянина. В этом случае прозвище указывало на сословие основателя рода — крестьянское происхождение. В условиях, когда фамилии только начинали закрепляться, такое прозвище было естественным способом отличить одного Ивана от другого: Иван Мужик, сын которого уже становился Мужиченко.

Прозвище Мужик, изначально присоединённое к наследственному имени, со временем полностью заменило его в повседневном обиходе и официальных документах, как это часто случалось с нецерковными именами. Сама фамилия Мужиченко при этом не несёт негативного оттенка, который слово «мужик» приобрело в городской речи XIX века: в момент её формирования это было нейтральное или даже уважительное обозначение взрослого человека, хозяина или труженика.