Фамилия Мякинков образована от прозвища Мякинок. Оно ведет свое начало от нарицательного «мякина» со значением «отходы, получаемые при обмолоте и очистке зерна хлебных злаков». Вероятно, прозвище Мякинок относится к числу «профессиональных» именований, содержащих указание на род деятельности основателя фамилии: он мог быть мельником. Кроме того, мякиной в сибирских говорах называли ботву моркови и свеклы, идущую на корм скоту. Исходя из этого, можно предположить, что Мякинком нарекли скотовода или того, кто занимался выращиванием овощных культур. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Мякинок, со временем получил фамилию Мякинков.