Фамилия Мышенин на первый взгляд прозрачна: корень «мыш-» намекает на мелкого грызуна. Но на деле тут интереснее суффикс и то, как именно образовалась фамилия. Это не типичное «Мышов» или «Мышкин», а форма с суффиксом -енин, который в русских фамилиях встречается реже, чем -ов или -ин. По модели образования Мышенин — это притяжательное прилагательное от прозвища или имени Мышена. Суффикс -еня в древнерусских именах часто имел ласкательный или уменьшительный оттенок (сравните: Гаврила — Гавриленя, Добрыня — Добрыня). То есть Мышена — это не просто «мышь», а скорее «мышонок» или человек, которого ласково называли Мышкой.

Прозвище Мышь на Руси давали не только за маленький рост или серую одежду. В народной культуре мышь — персонаж суетливый, тихий, но хозяйственный. В псковских и новгородских говорах «мышей» могли называть вора-домушника, который «мышкует» по амбарам. Однако чаще прозвище давали по внешнему сходству: юркому, вертлявому человеку с мелкими чертами лица. А форма Мышена — это уже производное от такого прозвища, возможно, данное сыну или младшему родственнику.

Географически фамилия Мышенин редкая и имеет чёткую привязку к центральной России и Поволжью. В дореволюционных переписях она встречается в основном в Нижегородской, Костромской и Владимирской губерниях. Это указывает на то, что фамилия сложилась в среде крестьян и посадских людей, а не в дворянской среде. В документах XVI–XVII веков упоминаются крестьяне Мышенины в вотчинах Троице-Сергиева монастыря, что подтверждает её неслужилое происхождение.

Интересная деталь: в некоторых диалектах «мышенина» называли шкурку мыши, которую использовали для подкладки рукавиц. Но это скорее народная этимология, чем реальный источник фамилии. Основная версия — прозвище Мышена, которое дали человеку, а потом оно закрепилось за его потомками. Если сравнить с однокоренными фамилиями (Мышкин, Мышев, Мышаков), то Мышенин стоит особняком именно из-за редкой модели на -енин, что делает её скорее «именной», чем чисто прозвищной.