Фамилия Мышляева образована от прозвища Мышляй. В его основе — древний глагол «мышлять», который в русских говорах значил сразу много: «мыслить, задумывать, затевать», «припасать, добывать, промышлять», а также «рассуждать или понимать». То есть прозвище Мышляй могли дать не только умному и сообразительному человеку, но и затейнику, активисту, тому, кто постоянно что-то придумывает или хлопочет по хозяйству. Любопытно, что в этом слове соединились две, казалось бы, разные черты — вдумчивость и деловая хватка, поэтому носитель прозвища мог быть как философом, так и предприимчивым добытчиком.

Потомок человека с таким прозвищем со временем получил фамилию Мышляева. Суффикс -ев указывает на типичную русскую модель отчества-притяжательности: Мышляев буквально означает «сын Мышляя». Форма Мышляева — женская ветвь этой же фамилии, и в документах она закрепилась за женщинами, тогда как мужчины писались Мышляевыми.

Процесс формирования русских фамилий был долгим, он растянулся на несколько столетий и завершился в основном к XIX веку. Поэтому точно сказать, где и когда именно возник род Мышляевых, можно только по итогам генеалогических исследований — например, через архивные метрические книги или ревизские сказки. Однако само прозвище Мышляй встречается в северных и центральных русских говорах, что позволяет предположить: фамилия могла зародиться в этих регионах, где слово «мышлять» было в ходу. Однокоренные фамилии — Мышляев, Мышляков, Мышленков — тоже ведут начало от этого глагола, но каждая из них закрепилась за отдельной семьей.