Фамилия Мыськов образована от личного имени или прозвища Мысько, а оно, в свою очередь, восходит к нарицательному «мысь». В псковских говорах это слово означало «белка». Такая цепочка — самая прямая и правдоподобная, хотя у неё есть ответвления, о которых стоит сказать отдельно.

Имя Мысько относится к пласту древнерусских мирских имён. Давая ребёнку имя от названия животного, родители следовали логике оберега: считалось, что природа воспримет младенца как своего, а самому человеку перейдут полезные качества зверя — в данном случае проворство, ловкость и хозяйственность белки. Это распространённая модель для имён, которые позже стали фамилиями: рядом с Мыськовым в одном ряду стоят Белков, Бобров, Зайцев.

Однако не исключено, что Мысько — не имя, а прозвище взрослого человека. Так могли назвать подвижного, шустрого, расторопного человека, поведением напоминающего белку. Либо — того, кто промышлял пушниной: белку добывали ради меха, и слово «мысь» в говорах могло закрепиться за охотником. Вторая версия объясняет появление прозвища не характером, а ремеслом, и она не менее убедительна, чем первая.

Суффикс -ко в имени Мысько — типичный для древнерусских личных имён и прозвищ, особенно распространённых на западе и юго-западе России, в белорусских и украинских землях. Такая форма часто указывает на уменьшительно-ласкательное или обиходное употребление имени. Фамильный суффикс -ов в Мыськов работает стандартно: он обозначает принадлежность, то есть «сын Мыська», «потомок Мысько».

Любопытно, что фамилия Мыськов не единственная в этом гнезде. Однокоренные Мысько, Мыскин, Мысков могут иметь ту же основу, хотя у Мыскина возможна и другая этимология — от слова «мыска» в значении «мыс», «возвышенность». Для Мыськова такая версия маловероятна: форма с суффиксом -ко тянет скорее к одушевлённому имени, чем к географическому термину.

Точных сведений о том, когда именно фамилия закрепилась и кто были первые носители, в открытых источниках нет. Но по модели образования она относится к древнему пласту русских фамилий, сложившемуся ещё в XV–XVII веках, когда мирские имена и прозвища начали переходить в наследственные прозвания. Так что человек с фамилией Мыськов почти наверняка носит память о предке, которого либо ласково сравнивали с белкой, либо уважали за расторопность и охотничью сноровку.