Фамилия Мытков — одна из тех, что образована от прозвища, связанного с древнерусской финансовой системой. Её основа — слово «мыт» или «мыто». В Древней Руси так называли пошлину за провоз товаров через заставы, за право торговли или проезд по мосту. Сборщика этой пошлины называли мытником, а человека, обязанного платить мыт или постоянно с ним сталкивавшегося, — Мытко. От этого прозвища через стандартный патронимический суффикс -ов и возникла фамилия. Мытков — буквально «сын или потомок Мытка».

Интересно, что фамилия эта не слишком частая, но географически она привязана к центральным и северным областям России. Встречается в старых писцовых книгах Новгородской и Вологодской губерний, что неудивительно: там проходили оживлённые торговые пути, и мытные заставы были делом обычным. Предок Мытковых мог быть либо самим сборщиком (мытником), либо, что вероятнее, купцом или крестьянином, который регулярно вёз товар на рынок и платил пошлину — за это его и прозвали Мытком.

Суффикс -ов указывает на типичную великорусскую модель образования фамилий. В отличие от украинских или белорусских фамилий на -енко, -ук, здесь мы видим классическое притяжательное окончание, закрепившееся в XVI–XVII веках. Других версий происхождения, кроме прозвищной, у фамилии Мытков нет — корень слишком конкретный и не даёт простора для альтернативных толкований (например, от имени или названия животного). Так что носители этой фамилии могут с высокой долей уверенности связывать свою родословную с миром древнерусской торговли и таможенных сборов.