Фамилия Начинкин напрямую связана с прозвищем Начинка. В её основе лежит нарицательное слово, которое в старину означало «предмет, которым набита, начинена пустота». Логика происхождения проста: прозвище Начинка могли дать человеку, чьё ремесло было связано с набивкой — например, мастеру, который набивал подушки пером или пухом. Такое занятие требовало аккуратности и сноровки, и имя мастера закреплялось за ним в быту, вытесняя официальное имя.

Словообразовательная модель здесь классическая для русских фамилий: суффикс -ин указывает на принадлежность. Фамилия Начинкин буквально означает «сын Начинки», «тот, кто из рода Начинки». Такой тип фамилий был широко распространён в северных и центральных русских говорах, где прозвища на -ка были особенно употребительны.

Интересно, что у слова «начинка» в диалектах были и другие значения. В некоторых регионах так называли не только содержимое пирогов или подушек, но и, например, кушанье, которым начиняли птицу перед запеканием. Прозвище Начинка могло закрепиться и за искусным поваром, и за тем, кто славился сытными угощениями. Впрочем, версия с ремеслом набивщика выглядит правдоподобнее: такие мастера были в каждом селе, а их труд был виден каждому.

Встречаются и однокоренные фамилии — Начин, Начинов, Начинин. Они образованы от тех же прозвищ, но с разными суффиксами, что говорит о независимом возникновении в разных местностях. Фамилия Начинкин не относится к числу распространённых, она редкая, и это делает её особенно ценной для потомков: по ней можно проследить, что предки жили оседло и прозвище закрепилось именно в их роду.

Таким образом, Начинкин — это фамилия-отчество, которая хранит память о конкретном человеке, его занятии и месте в общине. Потомки того самого Начинки, набивавшего подушки или готовившего начинку, со временем получили фамилию, которая сегодня звучит необычно, но когда-то была обычным бытовым именованием.