Фамилия Начинкин образована от прозвища Начинка, которое происходит от аналогичного нарицательного, что означает «предмет, которым начинена, набита пустота». Согласно этому, вполне возможно, что Начинкой прозвали человека, который занимался набивкой или начинкой чего-либо, например подушек. Так и прозвище Начинка закрепилось за человеком в качестве наиболее употребительного именования, а со временем легло в основу фамилии Начинкин. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Начинка, со временем получил фамилию Начинкин.