Фамилия Накиева — женская форма мужской фамилии Накиев. Её основа — тюркское мужское имя Накий, которое восходит к арабскому слову «наки» (نقي) — «чистый», «непорочный», «безупречный». В исламской традиции это имя нередко давали с пожеланием нравственной чистоты и честности. Таким образом, фамилия Накиева в буквальном смысле означает «принадлежащая чистому» или «потомок того, кого звали Накий».

Модель образования здесь типична для тюркских фамилий, русифицированных через суффикс -ев/-ова. В татарской, башкирской или казахской среде фамилия могла выглядеть как Накиев/Накиева, а в тюркских языках без русского окончания — как Накиулы (Наки-оглы) или Накикызы (Наки-дочь). Географически фамилия встречается прежде всего у татар, башкир и у народов Северного Кавказа, где распространены мусульманские имена арабского корня.

Интересная деталь: ударение в фамилии может падать как на второй слог (Наки́ева), так и на первый (На́киева). Второй вариант характерен для регионов, где имя Накий произносят с ударением на первый слог, что нередко встречается в татарском языке. Это даёт повод при разборе фамилии уточнять местный говор: по ударению можно предположить, из какой семьи человек родом.

В отличие от фамилий на -ов/-ев, образованных от русских имён, Накиева сохраняет прямую связь с арабским корнем без посредничества прозвища или профессии. Это делает её «прозрачной» для этимолога: основа не заросла дополнительными значениями.