Фамилия Налис — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных русских суффиксов -ов, -ин или -ский, что сразу наводит на мысль: перед нами не типичная крестьянская или дворянская фамилия центральной России. Скорее всего, её корни лежат за пределами великорусской ономастики, а сама фамилия могла быть адаптирована при переселении или сменить звучание при записи в документы.

Самый вероятный путь — польское или белорусское происхождение. В польском языке слово nalis или nalisz не имеет прямого хождения, но существует основа nali-, связанная с глаголом nalać (налить) или nalewać. Фамилия могла образоваться от прозвища Налис — человека, который разливал напитки, работал в корчме или держал шинок. В польской традиции прозвища ремесленников часто переходили в фамилии без дополнительных суффиксов, особенно в XVI–XVII веках. В таком случае Налис — это «наливайка», трактирщик или виночерпий.

Вторая версия отсылает к балтийским языкам, в частности к литовскому. По-литовски nalis — диалектное слово, означающее «мелкий, низкий» или «приземистый». Прозвище Налис могли дать человеку невысокого роста. Литва и историческая Жемайтия входили в Речь Посполитую, и фамилии на -ис там обычны. При переходе в русскую среду окончание -ис сохранилось, но фамилия стала восприниматься как неделимая основа.

Третья, менее вероятная гипотеза — происхождение от греческого имени или прозвища. В греческом νάλις (nalis) не зафиксировано, но существует корень ναύς (корабль). Однако это допущение строится только на внешнем сходстве и не подкрепляется географией бытования фамилии.

В России фамилия Налис встречается крайне редко, в основном на северо-западе — в Псковской, Новгородской областях, а также в Санкт-Петербурге. Это согласуется с версией о польско-литовском следе: именно через эти земли шла миграция шляхты и мещан в XVII–XIX веках. Сословно носители фамилии чаще всего были мещанами или однодворцами, реже — крестьянами.

С точки зрения словообразования фамилия проста: основа Нал- плюс окончание -ис, которое в славянских языках обычно указывает на мужской род и неизменяемость по падежам в русском языке (склоняется как существительное второго склонения: Налиса, Налису). В польском варианте могла бы писаться как Nalisz или Naliss, но в русской записи закрепилась форма с одним «с».