Фамилия Нанако — редкая и неочевидная. В русском языке её сразу выделяет окончание -ко, которое характерно для украинской, реже белорусской модели фамилий. Суффикс -ко (от уменьшительных форм на -к(о)) обычно означал принадлежность или прозвище: скажем, Бойко — «сын бойкого», Шевченко — «сын шевца». Но с основой «Нана» всё сложнее.

Самая прямая версия — от имени Нана. В православных святцах такого имени нет, зато оно известно у многих народов: у грузин Нана — богиня, мать, у греков Нанна — уменьшительное от Иоанна (Иванна), у народов Кавказа и Поволжья Нана — ласковое обращение к матери, бабушке или старшей сестре. Фамилия Нанако могла возникнуть как «сын Наны» или «потомок женщины по имени Нана». В украинской традиции так нередко образовывали фамилии от женских имён, если мать играла ключевую роль в семье или была вдовой.

Есть и вторая, менее очевидная версия — от прозвища Нанака. В южнорусских и украинских говорах «нанакать» означало «лепетать по-детски», «сюсюкать», а «нанака» — человек, который говорит невнятно или пришепётывает. Тогда фамилия закрепилась за тем, кого в селе дразнили за манеру речи. Подобные прозвища часто становились фамилиями: Лепета, Шепель, Заика.

Географически фамилия Нанако тяготеет к западным и центральным областям Украины, особенно к Полтавщине и Черкащине, где суффикс -ко особенно распространён. Встречается она и на Кубани, куда переселялись украинские казаки. В России она редка и почти не фиксируется в центральных архивах, что подтверждает её украинское происхождение.

Спорным остаётся только вопрос ударения. Если ударение падает на последний слог (Нанако́), это чистая украинская модель, как у фамилий Ковалько́, Бондарко́. Если на первый (На́нако) — возможно, это русифицированный вариант или фамилия из другого языка, например, из молдавского или гагаузского, где -ко тоже встречается, но реже. Надёжных статистических данных по этому вопросу нет, но большинство носителей в современных соцсетях ставят ударение на последний слог.

Так что, скорее всего, предки современного носителя фамилии Нанако — выходец из украинского села, чей отец или дед был либо «сыном Наны», либо человеком с характерной манерой говорить. Фамилия недворянская, крестьянская или казацкая, без громкой истории, но с живым бытовым корнем.