Фамилия Нечепурнова образована от прозвища Нечепурный, в основе которого лежит старое русское слово «чепурный» — опрятный, нарядный, щеголеватый. Приставка «не-» меняла значение на противоположное: нечепурным называли неряху, неопрятного человека. Но у слова был и второй оттенок смысла — «не нарядный», «без украшений». Поэтому прозвище могли дать не только тому, кто не следил за одеждой, но и человеку скромному, не любившему показной роскоши. В этом случае Нечепурный — спокойный, усидчивый, терпеливый, не гнавшийся за внешним блеском.

Модель образования простая и типичная для восточнославянских фамилий: к прозвищу отца добавили притяжательный суффикс -ов, а окончание -а указывает на женскую линию рода. Первоначально Нечепурнова — «дочь или жена Нечепурного». Мужской вариант — Нечепурнов.

Фамилия закрепилась в XV–XVI веках, когда в среде богатых людей — бояр, купцов, служилых — стали появляться наследственные именования, передававшиеся из поколения в поколение. Потомок человека с прозвищем Нечепурный со временем получал фамилию Нечепурнов, а его дочь или вдова писалась Нечепурновой.

Стоит заметить, что слово «чепурный» в диалектах сохранялось долго, и прозвище Нечепурный могло возникнуть независимо в разных регионах. Поэтому фамилия не привязана к одной местности, хотя чаще встречается в южнорусских говорах, где слово «чепуриться» (наряжаться) было особенно употребительным. Редкость фамилии объясняется тем, что прозвище с отрицанием «не-» давали не каждому: оно должно было ярко выделить человека среди соседей.