Фамилия Неготина — яркий пример того, как суффикс может рассказать о происхождении больше, чем корень. Форма на «-ин» указывает, что в основе лежит имя или прозвище, оканчивающееся на «-а» или «-я». То есть предок носителя этой фамилии был известен как Негота. Вопрос в том, что скрывается за этим прозвищем.

Самая прямая версия отсылает к слову «неготный» — в старых русских говорах так говорили о человеке неопрятном, неубранном, небрежном в одежде или делах. Прозвище Негота могли дать неряхе или тому, кто «не в готе» — то есть не в порядке, не при параде. В этом случае фамилия — не обидное клеймо, а бытовая характеристика, которая закреплялась за человеком в крестьянской среде, где прозвища были точными и беззлобными.

Есть и более редкая, но лингвистически интересная версия. В некоторых диалектах слово «негота» могло быть антонимом к «неготный» (негодный) и означать, наоборот, «пригодность» или «добротность». Однако такая трактовка встречается реже и хуже подтверждена источниками. Намного правдоподобнее, что Негота — это прозвище от прилагательного «негожий» (негодный, плохой), где корень «-гож-» со временем редуцировался до «-гот-» в разговорной речи.

С точки зрения географии, фамилия Неготин (и женская форма Неготина) встречается в центральных и северных областях России, особенно в Вятском крае и бывших новгородских землях. Там диалектное слово «неготный» было в ходу, и прозвища на «-ота» (типа Доброта, Быстрота, Негота) образовывали целые гнезда фамилий. Социально это, скорее всего, крестьянская фамилия: в дворянских родах подобные «отрицательные» прозвища почти не встречались, их заменяли на более благозвучные формы.

Таким образом, фамилия Неготина происходит от прозвища Негота, которое дали неопрятному или нерадивому человеку. Суффикс «-ин» буквально означает «чей?» — «дочь Неготы» или «жена Неготы». Спорных версий здесь немного, и самая обоснованная — бытовая, через диалектное «неготный».