Фамилия Негруза — редкий случай, когда основа слова сохраняет почти без изменений южнославянское или румынское прозвище. В польских, украинских и молдавских говорах «негруз» или «негруза» означало человека с тёмными волосами и смуглой кожей. Корень здесь тот же, что в слове «негр», но не через западноевропейские языки, а напрямую из латинского niger — «чёрный». В румынском прилагательное negru (чёрный) дало прозвище Negruță — «чернявый», «смуглый». Украинская и белорусская передача этого прозвища через «у» вместо «ю» (Негруза вместо Негрюза) указывает на давнее заимствование, когда звук [u] передавали как «у», а не через йотированную гласную.

Фамилия образована без типичного для восточных славян суффикса -ов/-ин. Это так называемая «застывшая» форма прозвища в именительном падеже. Такая модель встречается у потомков выходцев из Молдавского княжества, Речи Посполитой и у запорожских казаков, где фамилии часто фиксировали прозвище без дополнительных патронимических суффиксов. Сравните с украинскими фамилиями Негра, Негрий, Негрій — все они одного корня.

Географически фамилия Негруза тяготеет к западу и юго-западу бывшей Российской империи: её фиксируют в Подольской, Волынской губерниях, в Бессарабии. Носители могли быть потомками молдавских крестьян, переселившихся на земли Правобережной Украины, или же казаков, получивших прозвище за внешность. Социально фамилия не аристократическая — в реестрах дворянства XVIII–XIX веков она не встречается, что подтверждает её народное, прозвищное происхождение.

Спорных версий немного. Иногда Негрузу пытаются связать с польским niedogroza — «недогроза», но это натяжка: фамилия слишком точно повторяет румынское negru и украинское негро «негр». Фонетически правдоподобнее видеть здесь прямое указание на тёмный цвет волос или кожи предка — прозвище, которое закрепилось за родом без изменений.