Фамилия Некова — женская форма, а её мужской вариант звучит как Неков. В русской фамильной системе это типичная модель на -ов/-ев, указывающая на принадлежность: «чей?» — «Неков», то есть потомок человека по прозвищу или имени Нек. Основа здесь короткая, но неочевидная, и именно в ней кроется главная загадка.

Скорее всего, в основе лежит древнерусское неканоническое имя или прозвище Нек. В старину на Руси бытовали имена-обереги, данные «от сглаза»: Нек, Некрас, Нелюб, Немил. Родители нарекали ребёнка Неком в надежде, что злые силы не позарятся на «неказистого» младенца, а он вырастет здоровым и удачливым. Такая практика широко известна по актовым материалам XV–XVII веков. Если эта версия верна, то предок носителей фамилии Неков — человек, которого в детстве звали Неком, и прозвище закрепилось за ним на всю жизнь.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от прозвища, связанного с глаголом «некать» (устаревшее «говорить «не», отказывать, упрямиться»). В диалектах «нека» — упрямец, человек, который всему перечит. В этом случае фамилия описывает характер: родоначальник мог получить прозвище за привычку возражать. Однако эта гипотеза слабее: глагол «некать» встречается редко, и фамилий от него почти не зафиксировано, в отличие от многочисленных «обережных» имён.

Фамилия Некова — редкая. Она встречается разрозненно, без ярко выраженного «гнезда» в одном регионе, что типично для фамилий от нераспространённых личных имён. Сравните с более частыми однокоренными: Нечаев (от Нечай), Некрасов (от Некрас). Неков стоит в том же ряду, но его исходная форма почти исчезла из обихода, поэтому фамилия кажется сегодня необычной и трудной для интуитивного толкования.