Фамилия Некрылова происходит от прозвища Некрылый, которое образовалось от существительного «крыло» с отрицательной приставкой «не-». Такая модель — не редкость в русских прозвищах: так же устроены, например, Некрасов (от Некрас, то есть «некрасивый»), Немиров, Небольсин. Но если в основе большинства подобных имен лежит реальный недостаток или черта характера, то с Некрылым всё сложнее и интереснее.

Крылья с древнейших времен символизировали стремление ввысь, одухотворенность и внутреннюю чистоту. Поэтому прозвище Некрылый вряд ли означало физический изъян или слабость — скорее, это была охранительная практика. Родители, надеясь иметь красивого и здорового мальчика, нарочно давали ему «отрицательное» имя, чтобы обмануть злые силы. Считалось, что духи не позарятся на того, кого назвали «некрылым», и не заберут его в небесные обители раньше времени. Парадокс в том, что, называя сына Некрылым, родители желали ему как раз духовной чистоты и целомудрия — то есть тех качеств, которые приписывались крылатым существам. Имя становилось оберегом: «некрылый» на словах, но праведный и чистый по сути.

Потомок человека с прозвищем Некрылый со временем получил фамилию Некрылова. В этой фамилии необычно то, что она сохранила архаичную основу без смягчения: мы говорим «крыло», но фамилия закрепилась в форме «Некрылов», а не «Некрылёв». Это указывает на старую традицию произношения, когда корень не адаптировался под современные нормы. Такое написание — редкая примета глубокой древности прозвища.

Стоит упомянуть и альтернативную, менее вероятную версию: в некоторых говорах «некрылый» могло означать человека медлительного, «нелётного», неспособного быстро соображать. Но в контексте охранительных имен эта трактовка выглядит слабой — слишком уж распространена была на Руси традиция защитных прозвищ с приставкой «не-», чтобы видеть в каждом из них буквальный смысл. Фамилия Некрылова — редкий пример того, как отрицание стало пожеланием, а «бескрылость» обернулась метафорой духовной защиты.