Фамилия Немерцева — женская форма фамилии Немерцев, и чтобы понять её происхождение, нужно разобраться с мужским вариантом. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Немерец. В русских говорах слово «немерец» имело два основных значения. Первое — «немой человек», то есть тот, кто не говорит. Второе, более вероятное для фамилии, — так называли пришлого, нездешнего, человека «не нашей меры», то есть чужака, который не вписывается в местные обычаи или говорит на непонятном наречии. В этом смысле «немерец» — родственное слову «немец»: когда-то «немцами» называли всех иностранцев, чья речь казалась «немой», непонятной.

Суффикс -ев указывает на типичную русскую патронимическую модель: Немерцев — сын Немерца. Фамилия образована от прозвища, а не от крестильного имени, что говорит о её простонародном происхождении. Она могла закрепиться за крестьянином или посадским человеком, которого в округе прозвали Немерцем за его молчаливость или за то, что он пришёл из другой волости.

Интересно, что фамилия Немерцев нечастотна и имеет ярко выраженную географическую привязку. По данным современных исследований, большинство носителей этой фамилии (и её варианта Немерцева) сосредоточено в Воронежской и Липецкой областях, а также на юге Тамбовщины. Это зона позднего заселения Русского государства (XVI–XVII века), куда активно переселялись люди из центральных уездов. Прозвище Немерец могли дать именно такому переселенцу — «чужому» на новом месте, что и закрепилось в фамилии.

Таким образом, предки современных Немерцевых — скорее всего, вольные или служилые люди, которые осваивали чернозёмное пограничье России. Фамилия прямо указывает на их отличительную черту: либо на особенности речи и характера, либо на то, что они были пришлыми. В любом случае, это не книжная, а живая, народная фамилия, возникшая в бытовом общении.