Фамилия Непопушев — яркий пример того, как в русской ономастике отрицание превращается в часть фамильного прозвища. В её основе лежит не имя и не профессия, а, скорее всего, характеристика человека или его поступка. Если разложить фамилию на составляющие, то корень «попуш-» указывает на глагол «попускать» в значении «позволять, давать поблажку, спускать с рук». Приставка «не-» и суффикс «-ев» (указывающий на принадлежность: «чей?») дают нам буквальное значение: «тот, кто не попускает», то есть не прощает, не даёт послаблений, строгий и неуступчивый.

Вероятнее всего, в основе фамилии лежит мирское прозвище Непопух (или Непопуша). Так могли назвать человека с жёстким, принципиальным характером, который не спускал обид и не шел на компромиссы. В крестьянской и купеческой среде такие прозвища были распространены: они не столько оскорбляли, сколько метко описывали нрав. Менее вероятная, но допустимая версия — связь с глаголом «попугать» (испугать), где «непопух» могло означать «бесстрашный, не поддающийся страху». Однако фонетически и семантически версия с «попускать» выглядит убедительнее.

Фамилия Непопушев — довольно редкая. Она не встречается в боярских списках и дворянских родословных, что указывает на её позднее происхождение (XVII–XIX века) и, скорее всего, крестьянские или однодворческие корни. Географически фамилия тяготеет к южнорусским областям, особенно к Курской и Воронежской губерниям, где активно бытовали фамилии с отрицательной приставкой «не-» (Нечаев, Некрасов, Нелюбов). Суффикс «-ев» при твёрдом корне «попуш» — типичная модель для образования фамилий от прозвищ, оканчивающихся на согласный.

Стоит отметить, что фамилия не связана ни с каким «попом» (священником), как может показаться на первый взгляд. Ударение в ней падает на второй слог: Непóпушев. В дореволюционных метрических книгах можно встретить вариант написания «Непопушевъ» с твёрдым знаком на конце. Сейчас фамилия сохранилась в единичных экземплярах, в основном в Центральной России, и её носители, скорее всего, потомки тех самых строгих и неуступчивых людей, чья фамилия стала их краткой характеристикой.