Фамилия Непряев — редкий случай, когда прозвище, лёгшее в основу, почти наверняка не связано с отрицанием действия. Вопреки интуитивному прочтению «не прясть», корень здесь не глагольный, а именной. Основа фамилии — слово «непрядь» или «непря». В северных и центральных русских говорах так называли ленивого, нерадивого человека, который «не прядёт», то есть уклоняется от женской работы (прядение было сугубо женским занятием). Однако мужчина с таким прозвищем мог получить его не за лень, а за то, что занимался не своим делом — например, выполнял мужскую работу, избегая женской, или просто был неуклюж в домашних делах.

Суффикс -ев указывает на притяжательное значение: сын Непряя. Модель образования типична для русских фамилий XVI–XVII веков: сначала прозвище переходило на детей как полуотчество (Непряев сын), а затем закреплялось как наследственная фамилия. Встречаются и однокоренные варианты — Непряхин, Непрядин, но Непряев стоит особняком: основа усечена, без типичного для глагольных форм суффикса -х- (ср. «непряха»).

Географически фамилия привязана к северо-востоку России. В переписях XVII–XVIII веков Непряевы фиксируются в Вятской губернии, на Урале и в Пермском крае. Вятка и Урал — зона активного расселения старообрядцев, и прозвище могло закрепиться в среде, где ценилась трудовая этика: «непряй» — не просто ленивый, а тот, кто нарушает уклад. Позднее фамилия распространилась в Сибирь вместе с переселенцами, но за пределами этих регионов встречается редко.

Словообразовательная модель не оставляет простора для множества версий. Спор мог бы возникнуть, если бы основу связывали с диалектным «непря» — «негодный, плохой» (от общеславянского *neprędja), но это, по сути, то же самое значение, только с другим оттенком. Версия о происхождении от реки Непрядва (как у Непрядвин) маловероятна: топонимическая основа дала бы суффикс -ин или -ский, а не -ев. Так что Непряев — это фамилия-характеристика, прозвище по поведению, которое в крестьянской среде звучало бытово и без обидного подтекста.