Фамилия Нигаматулин напрямую связана с арабским именем Ниматулла, которое переводится как «милость Аллаха». Носитель фамилии — потомок человека, носившего это имя. Однако между именем и фамилией стоит промежуточная ступень — диалектная форма Нигаматула. Этот вариант возник в устной речи: в тюркских языках, где бытовало имя, звук «н» перед гласным часто переходил в «ң» или «г», что и закрепилось в русской передаче как «Нигам-».

Словообразовательная модель проста и прозрачна. К основе Нигаматул- добавили русский патронимический суффикс -ин, который отвечает на вопрос «чей?» и указывает на родство. Так, имя отца Нигаматула превратилось в фамилию его детей — Нигаматулины. Суффикс -ин, а не -ов, здесь не случаен: он стандартно присоединяется к основам, оканчивающимся на мягкий согласный или гласный, что и произошло с конечным «л» в имени.

Имя Ниматулла (в диалектной форме Нигаматула) широко распространено у мусульманских народов — татар, башкир, казахов, узбеков. Соответственно, фамилия Нигаматулин встречается преимущественно в Поволжье, на Урале и в Средней Азии. В русской среде она закрепилась через метрические книги и переписи населения, где имена записывали на слух, часто упрощая или адаптируя их под местное произношение.

Смысловая нагрузка фамилии — религиозная. Имя Ниматулла восходит к арабскому корню, означающему благо, дар и милость, и в полной форме звучит как «дар милости Аллаха». Родители, называя так сына, выражали благодарность Всевышнему за рождение ребенка и надеялись на его покровительство. Фамилия, таким образом, сохранила не только родовую память, но и древний смысл, вложенный в имя предка.

Стоит отличать Нигаматулина от однокоренных, но самостоятельных фамилий Нигматуллин и Нигматов. Первая образована от полной арабской формы с удвоенным «л» и суффиксом -ин, вторая — от усеченной основы Нигмат. Разница в написании часто отражает региональные особенности произношения: в татарском языке конечный звук имени смягчается, а в казахском — оглушается, что и дало разные варианты записи в документах.

Встречаются и формы Нигаматулов — с суффиксом -ов, который в некоторых регионах предпочли для благозвучия. Однако именно вариант с -ин считается исторически первичным, поскольку он точнее передает русскую традицию образования фамилий от имен, оканчивающихся на согласный.