Фамилия Никишечкин образована от имени Никишечка — уменьшительно-ласкательной формы крестильного мужского имени Никита. Имя Никита имеет греческие корни и переводится как «победитель». Так что в основе фамилии лежит не прозвище и не род занятий, а личное имя предка, которое в бытовом общении сократили и смягчили до домашней формы.

Сам суффикс -ечк- придаёт имени оттенок особой теплоты и принадлежности к семейному кругу. Такие формы были естественны в русской деревне и в городской среде, где человека могли звать не только по документальному имени, но и по тому, как его называли родные. Со временем имя Никишечка закрепилось за конкретным человеком как его постоянное обозначение, а уже от него по стандартной модели образовалась фамилия: Никишечка → Никишечкин, то есть «сын Никишечки», «потомок Никишечки».

Модель с суффиксом -ин здесь не случайна: она указывает на принадлежность к отцу или главе семьи. Если бы фамилия строилась от полной формы имени, мы бы получили Никитин, но выбор уменьшительной основы говорит о том, что в основе лежало обиходное, домашнее имя. Это типичная картина для русских фамилий, которые часто «консервируют» те формы имён, что звучали в живой речи столетия назад.

Стоит отметить, что фамилия Никишечкин довольно редкая. Она встречается преимущественно в центральной России и в Поволжье, но массового распространения не получила. Это объяснимо: фамилии от уменьшительных форм имён всегда уступали по частотности фамилиям от полных имён, поскольку в официальных документах чаще фиксировали каноническое имя, а не его домашний вариант.

Иногда Никишечкина путают с фамилией Никишин или Никишев, но это разные образования. Никишин и Никишев тоже происходят от производных форм имени Никита, но от других: Никиша и Никиш. Так что Никишечкин — отдельная ветвь, сохранившая в себе самую ласковую форму имени. Если ваш предок носил эту фамилию, он почти наверняка происходил из семьи, где имя Никита было в ходу, а самого родоначальника домашние звали именно Никишечкой.