Фамилия Никишичкин — один из тех редких случаев, когда в основе лежит не просто имя, а его ласкательная форма, прошедшая через две ступени уменьшительных суффиксов. Это делает её ценной для историка языка: она сохранила живую народную словообразовательную цепочку, почти исчезнувшую в современной антропонимии.

Разбираем по косточкам. Корень — Никиш-, который восходит к каноническому имени Никита (от греч. «победитель»). В русской простонародной среде имя Никита давало множество производных: Никиша, Никишка, Никишко. От формы Никиша (или Никиш) с помощью суффикса -ичк- образовали «Никишичка» — так в быту могли называть ребёнка или младшего члена семьи. А затем к этому прозвищу прибавился патронимический суффикс -ин, давший фамилию Никишичкин. Иными словами, предок носителя этой фамилии был сыном некоего Никишички (маленького Никиши), а сам Никиша — сыном Никиты.

Интересно, что суффикс -ичк- в русских фамилиях встречается намного реже, чем стандартные -ов/-ев или -ин. Он характерен для прозвищного, внутрисемейного именования. Если бы фамилия образовалась напрямую от Никиши, мы бы получили Никишин (самый частый вариант) или Никишев. Двойной суффикс указывает на то, что прозвище закрепилось за конкретным человеком, которого в деревне знали именно как «Никишичка» — возможно, за малый рост, юный возраст или просто из-за ласкового обращения. Такие фамилии редко встречаются за пределами центральных и северных областей России, где была сильна традиция «домашних» прозвищ.

Географически фамилия Никишичкин не массовая. Согласно данным переписей и телефонных справочников, её носители сосредоточены в основном в Поволжье (особенно в Нижегородской области) и на юге Центральной России. Встречается она и в Мордовии, что может говорить о межэтническом бытовании имени Никита у соседних народов.

Других версий происхождения, по сути, нет. Вариант от тюркского корня маловероятен — слишком прозрачна славянская основа. Спор мог бы возникнуть только в том случае, если бы в основе лежало не имя, а устаревшее слово «никишка» (вид рыбы или орудия труда), но ни в одном диалектном словаре оно не зафиксировано. Так что самая правдоподобная и единственная версия — цепочка от Никиты через двойное уменьшительное прозвище.