Фамилия Николайкин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Николайкин послужило церковное имя Николай. Николайка — просторечная уменьшительная форма крестильного мужского имени Николай, которое восходит к греческому Nikolaos, где nika означает «побеждать», а laos — «народ». Таким образом, потомок человека, обладающего именем Николайка, со временем получил фамилию Николайкин.

Словообразовательная модель здесь прозрачна: суффикс -ин указывает на принадлежность, то есть буквально фамилия отвечает на вопрос «чей?» — сын Николайки. Это типичный патроним, каких много в русском ономастиконе: рядом стоят Ивашкины, Петькины, Васькины. Но у Николайкиных есть своя особенность: имя Николай — одно из самых частотных в святцах. Его носили десятки святых, поэтому и производных форм на Руси возникло великое множество: Николаев, Николин, Никольский, Николашин, Никулин, Никаноров.

О точном месте и времени возникновения фамилии Николайкин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Однако можно предположить, что она закрепилась в северных и центральных русских говорах, где уменьшительная форма Николайка была особенно употребительна. В южнорусских регионах чаще звучали варианты Николенко, Николаенко, а в западнорусских — Николаевич.

Интересно, что форма Николайка фиксируется в исторических документах как минимум с XVI века. Это было не просто домашнее прозвище, а полноценное обиходное имя, которое использовалось в переписях и челобитных. Поэтому фамилия Николайкин могла возникнуть не только в крестьянской среде, но и среди посадских людей или служилых — патроним на -ин не был жёстко привязан к сословию.

Фамилия Николайкин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры. В ней сохранилась живая народная форма имени, которая сегодня почти вышла из употребления: современные носители чаще зовут Николаев Колей или Николкой, а ласкательное Николайка осталось в основном в песнях и сказках. Так что фамилия — это не просто метка рода, но и маленький музей русского языка, где застыла речь наших предков.