Фамилия Никульчина — это женская форма, образованная от мужской фамилии Никульчин. В основе лежит каноническое имя Николай, которое в народной речи приобрело множество уменьшительных форм. Одна из самых распространённых — Никула или Никулка. От неё с помощью суффикса -ин и появилось притяжательное прилагательное «Никульчин», то есть «сын Никулы». Со временем это прозвание закрепилось как фамилия.

Суффикс -ин указывает на принадлежность к роду. Такие фамилии типичны для северных и центральных областей России, где они вытесняли более южные формы на -ов/-ев. Никульчина, как и Никулин, Никульшин, Никольский, входит в большую группу фамилий, производных от имени Николай. Разница лишь в суффиксе: Никулин — самая частая форма, а Никульчин — более редкая, с уменьшительным оттенком.

С точки зрения словообразования фамилия прозрачна: основа Никульч- (от Никула с суффиксом -ч-, который в русских говорах давал ласкательные варианты) плюс суффикс -ин. Окончание -а в женском варианте — грамматический показатель рода.

Географически фамилия Никульчин встречается в основном в Вологодской, Архангельской и Кировской областях. Это зона бытования «северного» типа фамилий на -ин. В документах XVII века упоминаются крестьяне Никульчины в Устюжском уезде — предки, скорее всего, были свободными землепашцами или ремесленниками.

В словаре Б. Унбегауна «Русские фамилии» форма Никульчин не выделена отдельно, но разбирается модель: все фамилии от уменьшительных форм Николая (Никула, Никулка, Никулька) относятся к одному словообразовательному типу. Споров по этимологии нет: корень ясен, варианты объясняются диалектным произношением.