Основой фамилии Никушева послужило имя Никуш. Имя Никуш представляет собой уменьшительно-ласкательную форму имени Никита или Николай. Эти имена восходят к общей греческой основе со значением «побеждать» и переводятся «побеждающий» и «победитель народов» соответственно. Скорее всего, основатель рода Никушевых был человеком из простого сословия. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Никуш, со временем получил фамилию Никушева.