Фамилия Ницина — редкий случай, когда на первый взгляд очевидная основа может ввести в заблуждение. Самое простое прочтение — от слова «ница» (низина, низкое место) или «ницать» (никнуть, опускаться). Но здесь работает не столько корень, сколько суффикс. Фамилия образована по модели притяжательных прилагательных с суффиксом -ин: Ниц(а) + ин = Ницин, а в женском роде — Ницина. То есть первоначально это было отчество или прозвище: «чей сын?» — Ницин, «чья дочь?» — Ницина. В русской традиции фамилии на -ин обычно закреплялись за женщинами, если речь шла о вдове или дочери, но позже форма на -а стала просто склоняемым вариантом для женщин-носительниц.

Куда интереснее происхождение самой основы «Ница». Это могло быть прозвище человека невысокого роста или того, кто жил в низине. Однако есть и другая, менее очевидная версия: основа восходит к краткой форме крестильного имени Никита (в народном произношении — Микита, Никита). В диалектах имя нередко усекали до Ница, Ницко, Ницай. Тогда фамилия Ницина — это вариант фамилии Никитин, но с иной суффиксальной обработкой. Такие случаи встречаются в южнорусских и украинских говорах, где имя Никита давало формы Ниценко, Ницюк, а в великорусской среде — Ницин.

Географически фамилия редкая. В дореволюционных источниках она почти не встречается, что говорит о её локальном бытовании, возможно, в западнорусских или псковских землях, где были сильны диалектные сокращения имён. Сословная принадлежность — скорее всего крестьянская или мещанская: фамилии на -ин в этой среде были нормой.

Таким образом, у фамилии Ницина два равноправных объяснения: либо от прозвища по месту жительства (низина), либо от имени Никита через усечённую форму Ница. Второй вариант поддержан тем, что в русской ономастике фамилии от канонических имён — самый частый источник, а прозвища «Ница» от топографического признака встречаются реже.