Фамилия Нижебовский — одна из тех, что сразу вызывает вопрос: что в ней «ниже» и что «бов»? На первый взгляд корень кажется тёмным, но разбор по стандартной модели русского фамильного суффикса -ский даёт ключ. Такие фамилии обычно образовывались от географических названий — сёл, деревень или урочищ. Значит, предок носителя фамилии был либо выходцем из места с похожим названием, либо получил фамилию по владению землёй (для дворянских родов).

Самый прямой вариант — топоним Нижебово или Нижебова. В документах XIX века встречаются названия вроде Нижебовка, Нижебье, но все они редки и локальны. Основа «ниже-» в русских говорах могла означать не только «ниже по течению» или «внизу», но и «низкий», «приземистый», а в переносном смысле — «невысокий рангом». Вторая часть «-бов-» — это искажённое «бой» или «бойня»? Скорее всего, это диалектное «бовь» — удар, бой. Тогда Нижебовский могло значить «тот, кто ниже боя» — возможно, прозвище человека, который стоял в бою позади, в резерве, или, наоборот, был настолько низкоросл, что его не брали в передовую схватку. Версия спорная, но лингвистически допустимая.

Есть и вторая версия, более спокойная. «Бов» могло быть частью личного имени или прозвища. В старых польских и западнорусских говорах существовало имя Бов (сокращение от Бовислав или Бовемир). Тогда Нижебов — это человек, который живёт «ниже Бова» (по соседству или по социальному положению). Фамилия на -ский в таком случае типична для шляхты или однодворцев юго-западных губерний — Смоленской, Могилёвской, Витебской. Там же встречается и фамилия Нижебовский в метрических книгах XIX века, хотя и в очень малом числе.

В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) Нижебовский не упоминается — это говорит о её крайней редкости. Скорее всего, она принадлежит к числу «кабинетных» фамилий, образованных искусственно в духовных училищах или семинариях. Семинаристам часто давали фамилии по латинским или греческим корням, но здесь корень явно славянский. Возможно, это переосмысление польской фамилии Niżebowski (от niż — «низ»), которую русифицировали при переезде в центральные губернии. В любом случае, носитель фамилии Нижебовский — человек с корнями из западной части России или Беларуси, где смешивались русские, польские и литовские говоры.