Фамилия Низомидинов — редкий случай, когда в основе лежит не имя и не прозвище, а целая формула, заимствованная из арабо-персидской традиции. Её ядро — имя Низам-ад-дин (в русской передаче Низомидин), что означает «устроитель веры» или «порядок религии». В классическом арабском написании оно выглядит как نظام الدين (Низам-ад-дин) — сложное слово, где «низам» (порядок, устройство) соединяется с «дин» (вера, религия). Такие имена были особенно распространены в мусульманских семьях, где ценили учёность и духовный авторитет.

Русский суффикс -ов превратил восточное имя в фамилию по стандартной модели: Низомидин → Низомидинов. Это типично для народов Поволжья и Средней Азии, которые в XIX–XX веках, входя в состав Российской империи, получали фамилии на русский манер. По звучанию фамилия тяготеет к татарской или башкирской среде, где арабские имена часто адаптировались через местное произношение (например, замена «ад» на «о» в середине — Низомидин вместо Низам-ад-дин). Встречаются и варианты с другим огласованием: Низамутдинов, Низаметдинов, но Низомидинов — более редкая, диалектная форма, указывающая на конкретный регион бытования — скорее всего, западный Башкортостан или юго-восток Татарстана.

Интересно, что в отличие от многих фамилий, образованных от имени отца (патронимов), эта несёт в себе не родовое прозвище, а осознанное религиозное посвящение. Предок, получивший имя Низомидин, не просто носил его — оно задавало жизненную программу: быть устроителем, хранителем порядка в общине. В крестьянской среде это мог быть мулла, учитель медресе или просто уважаемый старейшина, к которому ходили за советом. Со временем имя закрепилось за потомками как фамилия, и теперь она хранит память о человеке, который в своём кругу отвечал за веру и порядок.

Других версий происхождения, кроме как от арабского имени, у этой фамилии нет: она прозрачно читается и не даёт повода для спекуляций. Если искать аналоги, то по структуре она стоит в одном ряду с такими фамилиями, как Хайрутдинов, Сафиуллинов или Гайнутдинов — все они построены по той же схеме: арабское имя плюс русский суффикс.