Фамилия Ночуев — редкий случай, когда прозвище «законсервировало» старую диалектную форму глагола. В основе лежит слово «ночуй» — повелительное наклонение от «ночевать». Так могли называть человека, который часто оставался на ночлег в чужих домах, сторожа или пастуха, не имевшего своего угла и кочевавшего по дворам. В северных и сибирских говорах «ночуй» закрепилось как прозвище бродяги или работника без постоянного жилья.

Суффикс -ев указывает на притяжательную модель: Ночуев буквально значит «сын Ночуя». Форма на -ев, а не на -ов, подсказывает, что основа оканчивалась на мягкий или шипящий звук — в данном случае на й. Это типично для прозвищ, образованных от глагольных команд: вспомните фамилии Бережков, Погоняев, Вертиев. Ударение, скорее всего, падает на второй слог: НочУев.

География фамилии узкая. По данным открытых источников, Ночуевы встречаются в Поволжье и на Урале, особенно в Оренбургской области и Башкортостане. Возможно, прозвище возникло в казачьей или крестьянской среде, где человек мог получить его за привычку «ночевать где придется» или за работу ночным сторожем. Второй вариант: прозвище давали тому, кто сам приглашал путников на ночлег — «ночуй у меня».

Спорных версий немного. Иногда фамилию связывают с тюркским корнем «ноч» (светильник), но это натяжка: русская модель с суффиксом -ев и глагольная основа говорят сами за себя. Ночуев — не «сын светильника», а потомок человека, которого звали Ночуй.

В дореволюционных переписях фамилия не фиксируется массово. Встречается единично в метрических книгах Оренбургской губернии конца XIX века. Известных носителей с общероссийской славой нет — это фамилия, которая осталась локальной, не разошедшаяся по дворянским или купеческим родам.