Фамилия Новацкая образована от прозвища Новак, которое в старину давали всякому новичку, пришельцу или новожилу. Основа здесь — слово «новый», то есть человек, который недавно появился в общине, приехал на новое место или только начал свое дело. Так могли назвать и молодого работника, и переселенца, и того, кто недавно женился и отделился от родительского дома.

Суффикс -цкий (в женском роде -цкая) указывает на восточно-украинское происхождение фамилии. Такая модель чаще встречалась на землях современной Украины и в южнорусских областях, где фамилии с этим суффиксом несли оттенок территориальной принадлежности: они отвечали на вопрос «из какого места?». В этом смысле Новацкая сближается с фамилиями вроде Ковальский или Горовой, которые тоже строились по местной словообразовательной традиции.

Не исключено, что основатель рода Новацких жил в селе Новаково Ивановского района Одесской области Украины. При переезде в другое место он мог получить прозвище Новак — по названию родного села или просто как новоприбывший, — а его дети уже стали Новацкими. Такая двойная мотивация типична для фамилий: прозвище могло закрепиться и по личному качеству, и по месту выхода, и часто обе версии имеют право на существование.

Со временем прозвище Новак, изначально присоединенное к наследственному имени, полностью заменило его в повседневной жизни и в официальных документах. Это обычный путь русских и украинских фамилий: прозвище отца становилось фамилией детей, и уже через поколение первоначальное крестильное имя забывалось. Носительница фамилии Новацкая может с равной вероятностью вести род и от новосела, и от выходца из Новакова, но в обоих случаях фамилия сохранила память о человеке, который когда-то был «новым» в своей округе.