Фамилия Оберт — редкий случай в русском ономастиконе. В отличие от большинства русских фамилий, она не имеет суффикса -ов, -ин или -ский, а застыла в форме, близкой к исходному слову. Такие «голые» фамилии часто указывают на позднее происхождение или на немецкое влияние.

Основная версия связывает фамилию с немецкой фамилией Obert. В немецком языке Obert означает «надзиратель», «старший» или «верхний», а также могло быть прозвищем человека высокого роста или занимавшего начальственную должность. В России фамилия Оберт могла появиться в XVIII–XIX веках вместе с переселением немецких колонистов, специалистов и ремесленников. Носителями могли быть обрусевшие немцы, работавшие на заводах, в аптеках или на государственной службе.

Менее вероятная, но возможная версия — происхождение от русского прозвища Оберт, образованного от глагола «обернуть» или «обертеть». Так могли назвать человека, который что-то обматывал, например, портного или извозчика, занимавшегося упаковкой грузов. Однако эта гипотеза слабая: в русских говорах нет устойчивого прозвища с таким корнем, и фамилия не встречается в старых писцовых книгах, где фиксировались исконно русские прозвища.

С точки зрения словообразования, фамилия Оберт стоит в ряду таких же «чистых» основ, как Шмидт, Шульц или Фишер. Отсутствие суффикса говорит о том, что она не прошла через стандартную русскую модель «отец — сын» (Иван → Иванов). Это типично для фамилий, принесённых извне и закрепившихся в неизменном виде.

Географически фамилия Оберт в России встречается редко, чаще всего в городах Поволжья и Сибири — там, где исторически селились немецкие колонисты. Встречаются единичные случаи в Петербурге и Москве, но в целом это нетипичная для центральной России фамилия.

Если ваши предки носили фамилию Оберт, велика вероятность, что они были либо потомками немецких переселенцев, либо людьми, получившими фамилию от немецкого начальства или врача. Документальных подтверждений этой версии без генеалогического поиска не найти, но именно она объясняет и форму, и редкость фамилии.