Фамилия Окнина — редкая и неочевидная. На слух её легко принять за производную от слова «окно», но с точки зрения русской словообразовательной модели тут загвоздка. Фамилии от «окно» обычно выглядят как Оконников, Оконнишников, Оконов — с суффиксами -ов или -ник. Суффикс -ин в фамилии Окнина указывает на основу, которая оканчивается на -а или -я. То есть в её основе лежит не «окно», а слово или имя, которое звучало как «Окна» или «Окня».

Самая вероятная версия: фамилия образована от прозвища Окня. В северных и сибирских говорах «окня» или «окнина» могло означать человека, который живёт у окна, любит выглядывать на улицу, подсматривать или, наоборот, сидеть дома, «как у окна». Но есть и более конкретное значение: в некоторых диалектах «окниной» называли проём, раму или место, где вставлено стекло. Прозвище могли дать стекольщику, плотнику, который делал оконные рамы, или просто человеку, жившему в доме с большим окном — настолько приметном, что оно стало его отличительной чертой.

Менее распространённая, но не исключённая версия — связь с гидронимом или топонимом. В России есть речка Окна (приток Дона) и несколько деревень с названием Окнино, Окны. Переселенцы из таких мест могли получить фамилию по названию родной деревни: «Окнин» — житель Окны, а в женском роде или в форме родительного падежа закрепилось Окнина. В пользу этой версии говорит то, что фамилия встречается в основном в центральных и южных областях России, а также на Украине — там, где есть сёла с похожими названиями.

Суффикс -ин — один из самых распространённых в русских фамилиях, он обозначает принадлежность: «чей?» — Окнин, то есть сын Окни. В документах XVIII–XIX веков фамилия могла записываться как Окнин, а форма Окнина — это либо женский вариант (жена Окнина), либо застывшая форма в родительном падеже, которая со временем стала фамилией. В современных справочниках фамилия Окнина фиксируется как редкая, с концентрацией в Воронежской, Ростовской областях и в Краснодарском крае.

Сравнение с однокоренными фамилиями — Оконников, Оконнишников — показывает разницу: там суффикс -ник прямо указывает на профессию (оконник — мастер по окнам). У Окнины суффикс -ин и основа без -ник говорят о том, что исходное прозвище было личным, а не профессиональным. То есть предок был не ремесленником, а просто человеком, которого так прозвали за связь с окном или местом.