Фамилия Ошмарин принадлежит к древнему пласту русских фамилий, образованных от прозвищ. В её основе лежит диалектное слово «ошмара», которым в старину называли вид палицы или большой кистень, использовавшийся для обороны в дороге. От этого слова появился и глагол «ошмарить» — «больно ударить, хлестнуть». Прозвище Ошмара могли дать либо владельцу такого оружия, либо человеку вспыльчивому, который привык решать споры кулаками.

Словообразовательная модель здесь проста и типична для XIV–XVII веков: прозвище Ошмара плюс притяжательный суффикс -ин, указывающий на принадлежность потомку. Изначально Ошмарин означало «сын Ошмары», а затем закрепилось как наследственная фамилия.

Прозвище это довольно старое. В «Ономастиконе» С.Б. Веселовского зафиксированы Ошмара Устин Кузьмин, крестьянин 1627 года, и Федор Ошмаров, крестьянин 1613 года из Арзамаса. Упоминание в арзамасских землях показательно: именно в Поволжье и северо-восточных уездах диалектная лексика с корнем «ошмар-» встречалась особенно часто.

Среди известных носителей фамилии — Пётр Григорьевич Ошмарин (1918–1996), советский и российский биолог, доктор биологических наук, профессор. Его научная карьера не связана напрямую с происхождением фамилии, но показывает, что род Ошмариных дал России людей академической науки.

Интересно, что фамилия сохранила редкий для современных русских фамилий корень. Однокоренных образований вроде Ошмаров или Ошмаркин почти не встречается, что делает Ошмариных носителями довольно уникального прозвищного имени, уходящего корнями в дорожный быт и народную военную культуру допетровской Руси.