Фамилия Пачишина — женская форма фамилии Пачишин, а та, в свою очередь, образована от прозвища или имени Пачиша. В отличие от более распространённых фамилий на -ов, -ев или -ин, здесь мы видим суффикс -ин, который в русской ономастике указывает на принадлежность: «чей сын?» — «Пачишин». Основа же — Пачиша — звучит необычно и заставляет искать её корни в диалектной лексике или в прозвищах, а не в календарных именах.

Самая вероятная версия связывает Пачишу с глаголом «пачкать» или существительным «пачкотня». В северных и центральных говорах «пачишей» могли называть неопрятного, неряшливого человека, который ходит в грязной одежде. Однако у этого корня есть и другое значение: «пачкать» в переносном смысле означало «делать кое-как, халтурить», так что прозвище могло относиться к плохому работнику. Менее вероятна, но возможна связь с польским или украинским словом «пач» (пакля, пучок волос) — тогда прозвище дали бы человеку с кудрявой или взлохмаченной головой.

Встречается фамилия в основном в центральных областях России, особенно в Тверской и Ярославской губерниях, где зафиксированы старые записи о крестьянах Пачишиных. В документах XIX века можно найти упоминания о семьях Пачишиных из деревень под Рыбинском и Кашином — это говорит о том, что фамилия была именно крестьянской, а не дворянской. Редкость фамилии делает её ценной для генеалогического поиска: если вы носите фамилию Пачишина, с большой вероятностью все ваши предки происходят из одного небольшого региона.

С точки зрения словообразования, форма Пачишина — чисто русская, с типичным для женских фамилий окончанием -а. Мужской вариант Пачишин склоняется как обычное прилагательное, и в исторических записях он встречается чаще, что неудивительно для патриархального документооборота. Интересно, что фамилия не подверглась «облагороженному» переоформлению в Пачишев или Пачишов — она сохранила архаичный суффикс -ин, который в современном русском языке уже не продуктивен для образования новых фамилий от личных прозвищ.