Фамилия Пакелин — наглядный пример того, как в русской ономастике редкая основа сочетается с прозрачным суффиксом. Если отбросить типовое окончание -ин, указывающее на принадлежность («чей?»), остаётся корень Пакел-. В русском языке такого слова нет, но зато оно есть в ряде финно-угорских языков, распространённых на северо-западе России. В карельском и вепсском «pake» означает «просьба», «прошение», а «pakel» — производное от этого корня. В северных говорах и в архангельских диалектах встречалось слово «пакель» — так называли просителя, человека, который ходил по миру с прошением, либо мелкого ходатая по делам. Скорее всего, прозвище Пакель дали человеку, который часто обращался с просьбами, писал челобитные, либо, наоборот, был настойчивым просителем. Вторая версия менее вероятна, но возможна: в некоторых говорах «пакель» — это вид рыболовной снасти, и прозвище могло перейти к рыбаку. Однако первое объяснение надёжнее, поскольку суффикс -ин в фамилиях северных регионов часто присоединялся к прозвищам, а не к названиям орудий труда.

Географически фамилия Пакелин тяготеет к Вологодской, Архангельской областям и Карелии — именно там фиксируются ранние упоминания. В XIX веке носители фамилии встречались среди государственных крестьян Олонецкой губернии. Сословно это была преимущественно крестьянская среда, хотя единичные случаи попадаются и среди мещан. Интересно, что фамилия не перешла в дворянские роды и не получила распространения в центральных губерниях — её ареал остался строго северным. Это позволяет предположить, что основа уходит в местную диалектную лексику, а не в каноническое имя или профессию общерусского масштаба.

С точки зрения словообразования фамилия стоит в ряду таких же редких северных фамилий на -ин: Панин, Пакин, Пакшин. Но если Панин образовано от сокращённой формы имени Павел, то Пакелин — от прозвища, не имеющего церковного источника. Это делает её ценной для краеведов: по фамилии можно восстановить бытовую лексику региона, которая почти исчезла из живого языка. В современных справочниках фамилия встречается редко, что подтверждает её локальный характер и отсутствие массового расселения.