Фамилия Панкрышева — женская форма, а мужская, Панкрышев, ведет начало от имени или прозвища Панкрыш. Это уменьшительная форма от крестильного имени Панкратий, что в переводе с греческого означает «вседержитель», «всемогущий». В русском просторечии имя Панкратий часто упрощали: Панкрат, Панкраша, Панкрашка, а также Панкрыш. Такая перестройка имени — с заменой «а» на «ы» — встречается в северных и южнорусских говорах, где звук «ы» после твердых согласных был более привычным, чем «а» в безударной позиции.

Словообразовательная модель здесь классическая: основа Панкрыш- плюс суффикс -ев. Суффикс -ев, а не -ов, указывает на то, что в основе лежало имя или прозвище, оканчивающееся на мягкий согласный или шипящий: Панкрыш (где «ш» — шипящий, твердый, но в древнерусской традиции после шипящих писали «е»). Такие фамилии типичны для центральной России и Поволжья, но Панкрышевы встречаются и на Урале — возможно, из-за миграций крестьян в XVIII–XIX веках.

Интересная деталь: в отличие от более распространенной фамилии Панкратов, где сохранилась полная форма имени, Панкрышев — результат народной переработки. Это говорит о том, что предок носителя фамилии был человеком не книжным, а из простонародья: имя ему дали в быту, сократив до удобного для повседневной речи варианта. Социально фамилия почти наверняка крестьянская или мещанская, без дворянских корней — в родословных книгах Панкрышевы не встречаются.

Спорных версий у фамилии немного. Иногда Панкрыш пытаются вывести из диалектного слова «панкрыш» — якобы так называли задиристого человека. Но это, скорее, народная этимология: никаких надежных лексикографических источников, фиксирующих такое слово, нет. Правдоподобнее всего — именно от Панкратия, тем более что в документах XVII–XVIII веков нередки записи «Панкрыш Иванов сын» — то есть отчество, которое потом закрепилось как фамилия.