Фамилия Папилин образована от имени собственного и относится к распространенному типу русских фамилий. Основой фамилии Папилин послужило церковное имя Папила. Редкое крестильное имя Папила в переводе с греческого языка означает «батюшка (священник)». Святым покровителем этого имени считается Папила Фиатирский (умер в 251 году), диакон, священномученик, пострадавший в городе Сарды в Малой Азии (ныне Сарт, Турция) в гонение императора Деция. Скорее всего, основатель рода Папилиных был уважаемым человеком. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Папила, со временем получил фамилию Папилин. О точном месте и времени возникновения фамилии Папилин в настоящее время говорить сложно, поскольку процесс формирования фамилий был достаточно длительным. Тем не менее, фамилия Папилин представляет собой замечательный памятник славянской письменности и культуры.