Фамилия Папиралин — редкий случай, когда основа слова почти наверняка не имеет отношения к тому, что приходит на ум первым. Соблазнительно связать её с «папиросой» или «папирусом», но в русской ономастике такие параллели не работают: суффикс -ин указывает на происхождение от личного имени или прозвища, а не от предмета.

Вероятнее всего, в основе фамилии лежит прозвище Папирала. Его могли дать человеку по характерному поведению или внешности. В русских говорах слово «папира» или «папирка» (с ударением на второй слог) означало «ротозей, разиня» или, в ином контексте, «тот, кто много говорит, болтун» (от глагола «папить» — болтать, пустословить). Таким образом, Папирала — человек, которого прозвали за привычку разевать рот или за пустую болтовню. Форма на -ала типична для прозвищ, образованных от глагольных корней (ср. Ломала, Кидала), и впоследствии легко обрастала фамильным суффиксом -ин.

Менее распространённая, но лингвистически возможная версия — связь с диалектным «папера» (бумага) в значении «бумажный человек», то есть тот, кто работает с бумагами, писарь или чиновник. Но против этой версии говорит то, что фамилии от слова «бумага» в России образовывались иначе — Бумагин, Бумажников. Форма «Папиралин» с корнем «папир-» скорее указывает на устное, бытовое прозвище, чем на профессию.

Географически фамилия тяготеет к южнорусским и западнорусским областям, где аканье и замена «о» на «а» в безударной позиции были нормой. Встречаются варианты написания «Папиралин» и «Попиралин» — второй мог возникнуть под влиянием глагола «попирать» (попирать ногами), но это уже народная этимология, не имеющая отношения к исходному значению. В любом случае, фамилия остаётся очень редкой и не попала в массовые справочники.