Фамилия Патаруева — редкий случай, когда географический след в основе слова говорит о происхождении больше, чем прозвище или профессия. В её ядре лежит топоним Патары — название древнего ликийского города на юге современной Турции. В русской традиции это имя закрепилось благодаря святому Николаю Чудотворцу, который, по житию, родился именно в Патарах. Отсюда и цепочка: уроженец Патар — патарец — патаруй, а далее, с помощью суффикса принадлежности -ев, — фамилия Патаруев. Женская форма Патаруева образована по стандартной модели.

Суффикс -уй в основе («Патаруй») — нечастая, но известная в русской антропонимии модель, встречающаяся в фамилиях от прозвищ, образованных от географических названий через суффикс -уй, который мог придавать слову оттенок прозвания по месту жительства или происхождения (сравните: Костромской — Костромуй, Ростов — Ростуй). В данном случае «Патаруй» — это, скорее всего, прозвище человека, который побывал в Патарах, торговал с этим регионом или, что более вероятно, был связан с церковным почитанием Николая Мирликийского — паломник, священник или монах, получивший такое прозвание в монастырской среде.

Правдоподобнее всего версия о духовном сословии. Фамилии на -уев, образованные от названий святых мест или церковных реалий, нередко встречались среди семинаристов и священников. Им могли дать «географическую» фамилию по месту рождения святого, чтобы выделить среди множества Никольских и Николаевых. Таким образом, предок Патаруевых мог быть выпускником духовной семинарии, получившим фамилию в честь родины Николая Чудотворца. Менее вероятно, что основа — это искажённое тюркское или кавказское имя, так как звуковой облик «Патаруй» нехарактерен для тюркских языков, а греческое «Патара» передаётся в русском именно так.

Фамилия крайне редкая. Встречается преимущественно на юге России, в Поволжье и в регионах с сильным старообрядческим или церковным влиянием. Носители Патаруевой, скорее всего, имеют корни в среде русского духовенства или крестьян, получивших фамилию от священника-основателя рода. Других версий, объясняющих происхождение с той же степенью уверенности, нет: попытки вывести корень из глагола «патарить» (говорить вздор) — народная этимология, не подтверждённая историческими источниками.