Фамилия Пайцан — редкая и неочевидная с точки зрения происхождения. В ней нет привычных славянских суффиксов -ов, -ин или -ский, поэтому сразу понятно: корни, скорее всего, не великорусские. Чтобы понять, откуда она взялась, нужно смотреть на её звучание и возможные языковые параллели.

Скорее всего, фамилия Пайцан имеет еврейское (ашкеназское) происхождение. В её основе может лежать идишское слово «пайц» (פּײַץ) — так в некоторых диалектах называли перец, а также острую, пряную пищу. Суффикс -ан характерен для фамилий, образованных по модели «носитель признака»: Пайцан — тот, кто имеет отношение к перцу, возможно, торговец пряностями или человек с острым, «перчёным» характером. В пользу этой версии говорит и то, что в еврейской ономастике немало фамилий, образованных от названий продуктов и блюд (например, Файн — «вино», Цукер — «сахар»).

Вторая версия, менее вероятная, но возможная — тюркское происхождение. В некоторых тюркских языках есть слово «пай» (доля, часть, счастье), а «цан» могло быть искажённым вариантом «джан» (душа) или суффиксом принадлежности. Тогда фамилия могла означать «счастливая душа» или «доля души». Однако эта гипотеза требует допущений о том, как слово перешло в русскую фамилию, и не подкрепляется массовыми примерами.

Географически фамилия Пайцан встречается в основном на территории бывшей черты оседлости — в Украине, Беларуси, Молдове, а также в России в среде потомков переселенцев. Это косвенно подтверждает еврейскую версию. Встречаются варианты написания: Пайцан, Пайзан, Пейцан — разница в гласных связана с особенностями произношения в разных диалектах идиша.

Таким образом, наиболее вероятно, что предки носителя фамилии Пайцан были еврейскими торговцами, возможно, связанными с рынком пряностей, или же получили прозвище за вспыльчивый, «острый» нрав. Фамилия недворянская, мещанская или купеческая, и её редкость делает её особенно ценной для генеалогического поиска — найти однофамильцев будет непросто, но каждый найденный, скорее всего, окажется дальним родственником.