Фамилия Пекшеев образовалась от прозвища Пекшей. Оно, скорее всего, восходит к названию реки Пекша, протекающей во Владимирской области. Сам гидроним этимологически связан с марийским словом piks, которое переводится как «стрела». Вполне возможно, что основатель рода Пекшеевых был выходцем из поселения, располагавшегося на берегу Пекши. Согласно другой гипотезе, прозвище Пекшей ведет свое начало от эрзянского слова «пекшее», которое имеет значение «липа». В таком случае Пекшеем могли называть человека, жившего неподалеку от липовой рощи, или мастера, делавшего различные вещи из древесины липы. Однако не исключено, что именование Пекшей могло употребляться в качестве внутрисемейного имени, которое давалось ребенку, родившемуся во время цветения липы (июль). Таким образом, человек, предка которого звали Пекшей, со временем получил фамилию Пекшеев. Так, например, в Книгу памяти Кировской области внесен мариец Анисим Данилович Пекшеев, родившийся в 1891 г. в деревне Мари-Васькино Яранского района Кировской области. В этом же источнике записан еще один уроженец деревни Мари-Васькино – Дмитрий Кондратьевич Пекшеев (р.1904), работавший церковным старостой Уртминской церкви. В Книге памяти Ульяновской области содержится информация о стрелочнике Дмитрии Александровиче Пекшеев (р.1886) родом из Кировской области.