Фамилия Пекшев напрямую связана с прозвищем Пекш, которое носил её основатель. В русских говорах словом «пекша» называли небольшой горшок, чугунок или кашничек. Поэтому первая и самая очевидная версия происхождения указывает на род занятий: предок мог быть гончаром, делавшим такую утварь, либо торговал ею. Прозвища по ремеслу были широко распространены, и они легко закреплялись за человеком и его потомками.

Однако у этой фамилии есть и географическая версия, которую не стоит сбрасывать со счетов. Существует река Пекша во Владимирской области, приток Клязьмы. В этом случае прозвище Пекш мог получить человек, долго живший на берегах этой реки или в окрестностях. Такая практика — называть человека по месту жительства или по реке — встречалась повсеместно, и она не менее правдоподобна, чем «гончарная».

Сам механизм образования фамилии прост и типичен для центральной России. Суффикс -ев указывает на принадлежность: Пекшев буквально означает «сын Пекша» или «человек из рода Пекша». Со временем прозвище главы семейства перешло к его детям и закрепилось за ними уже как фамилия.

Какая из версий вернее — сказать сложно. Обе имеют право на существование, но «ремесленная» выглядит чуть предпочтительнее: прозвища по профессии встречались чаще, чем прозвища по малым рекам, особенно если человек не жил в непосредственной близости от воды. К тому же слово «пекша» в значении горшка фиксируется в диалектах, что даёт прозвищу самостоятельную основу, не зависящую от названия реки.

Родственные фамилии, например Пекшин или Пекшуев, если они существуют, скорее всего, образованы от того же корня, что подтверждает его распространённость как основы для прозвищ. Сама фамилия Пекшев звучит по-крестьянски основательно и указывает на среду, из которой вышел род, — скорее всего, это были ремесленники или вольные землепашцы, а не дворяне.