Фамилия Пекшев происходит от прозвища Пекш. В его основе лежит диалектное слово «пекша» — «маленький горшок, чугунок, кашничек». Исходя из этого, можно предположить, что основатель рода Пекшевых был гончаром или занимался продажей различной посуды. Существует также версия, что прозвище Пекш связано с названием реки Пекша, которая протекает во Владимирской области и впадает в Клязьму. В таком случае Пекшем прозвали того, кто долгое время жил на берегу этой реки или на близлежащей территории. Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Пекш, со временем получил фамилию Пекшев.