Фамилия Пепин образована от личного прозвища Пепа. В словаре Владимира Даля зафиксировано диалектное слово «пепа», которое в псковских говорах означало «лентяй, неумный человек». Скорее всего, прозвище носило иронический оттенок: так могли поддеть взрослого человека за лень или недалёкость. Однако есть и другая, более тёплая версия происхождения. В народной традиции нередко давали детям «обережные» имена с отрицательным значением, чтобы отвести беду. Надеясь вырастить сына умным и работящим, родители могли назвать его Пепой — как бы заранее «задобрив» судьбу.

Суффикс -ин в фамилии указывает на принадлежность: Пепин буквально значит «сын Пепы», «из рода Пепы». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён и прозвищ, оканчивающихся на гласный или мягкий согласный. По этому же принципу появились, например, фамилии Фомин или Ильин.

Псковская привязка слова «пепа» — любопытная деталь. Она позволяет предположить, что корни фамилии могут лежать в северо-западных русских говорах, хотя со временем носители фамилии, конечно, расселились далеко за пределы этого региона. Точное место и время возникновения фамилии Пепин назвать сложно — процесс формирования русских фамилий растянулся на несколько столетий, и письменные источники по такой редкой фамилии скудны.

Сама фамилия звучит коротко и цепко, в ней нет ничего книжного или искусственного. Это живое прозвище, которое когда-то дали конкретному человеку, а оно переросло в родовое имя. Сегодня Пепины — редкая фамилия, и её носители могут считать себя хранителями небольшого, но колоритного кусочка славянской лексики, который сохранился благодаря семейной памяти.