Фамилия Перенёлкин — редкий случай, когда прозвище закрепилось не за самим человеком, а за его детьми, причём через необычный суффикс. Основа здесь — не имя и не профессия, а глагол «перенелёкать» или существительное «перенёлка». В русских говорах, особенно северных и сибирских, так называли перепелку — птицу семейства фазановых. Суффикс -к- в основе (перенёлк-а) указывает на уменьшительно-ласкательную форму: не просто перепел, а маленькая, домашняя перепёлочка.

Но почему фамилия оканчивается на -ин, а не на -ов? Если бы предка звали Перенёлок, мы бы получили Перенёлков. А Перенёлкин — это от прозвища Перенёлка, которое могли дать человеку за сходство с птицей: невысокий, быстрый, с характерным голосом или просто любитель перепелиных яиц. Суффикс -ин в русских фамилиях традиционно присоединялся к основам на -а/-я, поэтому Перенёлка → Перенёлкин. Такая модель типична для прозвищ, а не для крестильных имён.

Есть и другая, менее очевидная версия, которую редко упоминают. В некоторых диалектах «перенёлка» могла означать не птицу, а предмет утвари — например, небольшую плетёную корзину для ягод или грибов (от «переносить» + уменьшительный суффикс). Тогда прозвище получил корзинщик или торговец, носивший товар в такой корзине. Но эта гипотеза слабее: документальных подтверждений такого значения почти нет, а птичья версия подкрепляется множеством аналогичных фамилий — Перепёлкин, Соколин, Воробьин.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России, особенно к Вологодчине и Архангельской губернии, где перепела водились в изобилии и где диалектное слово «перенёлка» звучало естественно. В XIX веке Перенёлкины чаще всего числились государственными крестьянами — ни дворянских родов, ни купеческих династий с этой фамилией не зафиксировано. Это типичная «птичья» фамилия, возникшая в крестьянской среде и сохранившая живую связь с народной речью.