Фамилия Перен — один из тех случаев, когда внешняя простота обманчива. На слух она воспринимается как иноязычная, и это первая зацепка: в русской среде фамилии на -ен крайне редки, а в исконно русской модели словообразования такого суффикса нет. Поэтому искать её корни стоит не в восточнославянских землях, а в другом направлении.

Наиболее вероятное происхождение — из идиша или немецкого языка. В основе лежит мужское личное имя Перец (идиш פּרץ, от библейского Перец — «прорыв», «разрыв»), которое в разговорной речи и при записи могло сократиться до формы Перен. Подобная редукция характерна для еврейских фамилий, образованных от имён через суффиксацию: Перец → Перель → Перен. Вторая версия, более редкая, связывает фамилию с немецким словом «Perle» (жемчуг) или его диалектными вариантами, но здесь меньше фонетического правдоподобия.

В русском контексте фамилия Перен могла появиться у представителей еврейского населения на территории бывшей Речи Посполитой, а затем — в черте оседлости Российской империи. Географически она встречается в Беларуси, на западе Украины, в Литве и Польше. В дореволюционных метрических книгах и ревизских сказках её носители — мещане и купцы, реже ремесленники. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано.

Есть и другая, почти забытая линия: в польском языке слово «pierzeń» означало «перец» (пряность). Фамилия Перен могла возникнуть как прозвище торговца пряностями или человека с острым характером. Но эта версия слабее, так как в польском слово пишется через «е» с огласовкой, а фамилия закрепилась без неё.

Словообразовательно фамилия стоит особняком: она не имеет типичных русских суффиксов (-ов, -ин, -ский), поэтому её склонение — мужской род (Перен, Перена), женский — не склоняется. В современной России фамилия редкая, её носители рассеяны по всей стране, но наибольшая концентрация сохраняется в западных регионах.