Фамилия Перхунков — звонкий пример того, как русская фамилия может сохранить в себе не только имя или профессию, но и звуковую характеристику человека. В её основе лежит не церковное имя, а прозвище — Перхун. Этот корень напрямую связан с глаголом «перхать» (кашлять, откашливаться) или «перхнуть» (издать отрывистый кашель). В диалектах слово «перхун» означало человека, который часто кашляет, страдает одышкой или просто говорит хрипло, с надрывом. Это яркая, «слышимая» черта, которая легко закреплялась за человеком в быту.

Модель образования проста и типична для восточнославянских фамилий: к прозвищу Перхун добавился суффикс -к-, обозначающий принадлежность (буквально «сын Перхуна»), а затем стандартный суффикс -ов. Получилась форма «Перхунков» — чей? — сын Перхунка. Суффикс -к- в данном случае не уменьшительно-ласкательный, а патронимический, как в фамилиях Петьков, Васьков, Митьков. То есть Перхунков — это потомок человека, которого в семье или в общине звали Перхунко.

Интересно, что фамилия не имеет отношения к украинскому слову «перхун» (индюк) — в русском контексте это значение не зафиксировано. Более того, в некоторых северных и сибирских говорах «перхун» могло быть прозвищем для человека с резким, скрипучим голосом или для того, кто постоянно «перхает» в разговоре. Таким образом, первый носитель фамилии, скорее всего, был крестьянином или ремесленником, выделявшимся характерной манерой говорить или кашлять.

Фамилия редкая, её географическое ядро, по данным современных исследований, тяготеет к Псковской области и югу Ленинградской области — регионам, где диалектное слово «перхать» было особенно употребительно. Встречаются Перхунковы и в Сибири, куда фамилия могла попасть с переселенцами. Из-за редкости фамилия не обросла мифами о дворянском происхождении или связи с иностранными корнями — перед нами чисто народное, бытовое прозвище, которое без прикрас описывало предка.