Фамилия Пешахонов восходит к названию города Пошехонье (Ярославская область). Жителей этого города, то есть берегов реки Шехны (Шексны), называют пошехонами. В XVII веке на месте современного города Пошехонье находилось село Пертома (финно-угорское название), в котором с 1680 года размещалась воеводская канцелярия. В 1777 году указом Екатерины II село было переименовано в город Пошехонье (как центр местности Пошехонье) и включено в состав Ярославского наместничества. С XVIII века в Пошехонье развивался золотобойный промысел (изготовление тончайших листов сусального золота, серебра, алюминия). Очевидно, что основатель рода Пешахоновых получил прозвище Пошехон (или Пешахон), будучи уроженцем названного города. В некоторых говорах слово «пошехон» звучало как «пешахон». Именно эта диалектная форма и легла в основу фамилии Пешахонов.