Фамилия Петрученик — редкий случай, когда суффикс «-еник» сразу выдаёт географию и способ образования. В русском языке такая модель встречается редко, зато она типична для украинской и белорусской ономастики: суффикс «-еник» (как в фамилиях Гриценко, Иваненко) видоизменился в «-еник» под влиянием местных говоров. Но здесь не просто вариация на «-енко» — основа указывает на имя Пётр.

Корень фамилии — каноническое имя Пётр (от греческого πέτρος — «камень», «скала»). От него образовали уменьшительную форму Петруча: так в быту называли сына Петра или человека, связанного с этим именем. Суффикс «-еник» в украинской традиции часто означал принадлежность или происхождение: Петрученик — буквально «сын Петручи», то есть потомок Петра. Аналогичные фамилии — Петрученко, Петручков — встречаются в Черниговской и Полтавской областях, и Петрученик, скорее всего, из того же ареала.

Есть и другая версия, менее вероятная: суффикс «-еник» мог указывать на род занятий или прозвище. В польском языке «petruk» — грубое прозвище для упрямого человека, а «-nik» — типичный суффикс для названий лиц по действию (например, «robotnik» — работник). Но для фамилии Петрученик эта гипотеза слабая: основа «Петруч-» явно от имени, а не от нарицательного слова, и суффикс «-еник» здесь патронимический, а не профессиональный.

В документах XIX века фамилия встречается в Волынской и Киевской губерниях, преимущественно среди крестьян и мещан. Дворянских родов с такой фамилией не зафиксировано — это типичная «народная» фамилия, которая закрепилась за потомками Петра без искусственных сословных приставок. В современной России она редка, но не исчезла: носители живут в Краснодарском крае и Ростовской области, куда переселялись украинские крестьяне в конце XIX века.