Фамилия Петруняев — редкий случай, когда один и тот же корень может вести в две совершенно разные стороны. Внешне она похожа на отчество от имени Пётр, но суффикс -яев выдаёт в ней нестандартную модель, характерную для северных и восточных русских говоров.

Разберём основу. Если исходить из канонического имени Пётр, то ожидаемая форма отчества — Петров, Петрушин или Петряев. Суффикс -ун- в русской антропонимии часто служил для образования прозвищ и некалендарных имён: Петрун, Петруня — так могли называть человека, который либо был младшим в семье (уменьшительное), либо, наоборот, обладал каким-то ярким качеством, связанным с «петушиным» характером. В диалектах слово «петрун» фиксировалось как прозвище драчливого или задиристого человека, а также как название птицы — петуха. Фамилия Петруняев буквально означает «сын Петруня», где Петруня — это обиходная форма имени Пётр, но с дополнительным суффиксом, который в некоторых регионах (Вятка, Пермь, Архангельская губерния) присоединяли к основе, чтобы подчеркнуть принадлежность к роду.

Вторая, менее очевидная, но вполне реальная версия — связь с тюркским именем Петрун. В Поволжье и Приуралье, где русские фамилии часто возникали на стыке культур, имя Петрун могло быть адаптацией тюркского имени Бетрун или Петрун (от арабского «фатх» — победа). Носители такого имени были среди крещёных татар и чувашей. В этом случае фамилия Петруняев — не отчество от русского Петра, а русифицированная форма тюркского имени с тем же патронимическим суффиксом.

Географически фамилия тяготеет к северо-востоку России. Встречается она нечасто, но заметна в Кировской области, Удмуртии и Пермском крае. В этих местах суффикс -яев (вместо более привычного -ов) — не ошибка, а норма местного словообразования. Сравните: фамилии Корякин, Ширяев, Беляев — все они образованы по той же модели, где -яй- является диалектным вариантом суффикса принадлежности.

Что касается социального статуса предков, то прямых указаний нет. Но по модели образования (отчество от прозвища или уменьшительного имени) и по региону бытования можно предположить, что Петруняевы — потомки крестьян или посадских людей, а не дворян. Фамилии на -яев редко встречаются среди высших сословий, они формировались в среде, где имя или прозвище отца записывали «на слух», без строгих канцелярских правил.

Таким образом, если вы Петруняев, ваш предок, скорее всего, жил на Вятке или в Прикамье, а его звали Петруня — либо в честь святого Петра, либо за бойкий нрав. И в том и в другом случае фамилия сохранила живую, нестандартную форму, которая не вписалась в общерусский стандарт, но именно этим и ценна.