Фамилия Петруняшин сразу привлекает внимание суффиксом -ин. В русской ономастике это типичный «притяжательный» суффикс, указывающий на принадлежность: «чей?» — «Петруняшин». Значит, в основе лежит личное имя или прозвище Петруня. Это уменьшительно-ласкательная форма от крестильного имени Пётр, которое пришло на Русь из греческого и означает «камень» или «скала».

Формы на -уня в народной среде встречались часто: Петруня, Ванюня, Мишуня. Так называли ребёнка или младшего по возрасту человека. Следовательно, Петруняшин — буквально «сын Петруни» или «потомок Петруни». Фамилия образовалась по той же модели, что и Ивашин, Федюшин, Прошин, и относится к разряду патронимических (по отцу).

Интересна география. Фамилия Петруняшин не относится к числу широко распространённых, но её очаги прослеживаются в центральных и южных областях России. Встречается она и на Украине, где суффикс -ин так же продуктивен. В словарях фамилий (например, у Б. Унбегауна) такой тип разбирается как характерный для северных и центральных говоров, хотя сама основа Петруня могла бытовать повсеместно.

Есть и более редкая версия происхождения — не от имени, а от прозвища. В некоторых говорах «петруня» могло означать не только уменьшительное от Пётр, но и шутливое прозвище человека маленького роста или того, кто «петрушится» — суетится, мельтешит. Однако эта гипотеза менее вероятна: в основе фамилий на -ин почти всегда лежит либо имя, либо прозвище в форме, близкой к имени.

Сословно Петруняшины могли быть крестьянами, мещанами или однодворцами. Суффикс -ин не даёт точного указания на дворянство — такие фамилии чаще всего встречались в непривилегированных слоях. В документах XIX века Петруняшины фиксируются в Курской, Тамбовской и Воронежской губерниях, что согласуется с ареалом фамилий на -ин.

Таким образом, Петруняшин — фамилия, которая прямо говорит о предке по имени Петруня. Она несёт в себе отпечаток народной речевой культуры, где ласкательные формы имён были нормой, а не исключением.